Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Slc6a20aQ8VDB9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a20aQ8VDB9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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