Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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