Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RttnQ8R4Y8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RttnQ8R4Y8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms