Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mterf3Q8R3J4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mterf3Q8R3J4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms