Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r200Q8R281 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Vmn1r200Q8R281 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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