Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebf4Q8K4J2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebf4Q8K4J2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms