Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alkbh6Q8K2U2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Alkbh6Q8K2U2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms