Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcho1Q8K285 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms