Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Abcf3Q8K268 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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