Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh3Q8K1E6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms