Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx5Q8K1E0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx5Q8K1E0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms