Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lmbrd1Q8K0B2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lmbrd1Q8K0B2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms