Protein–RNA interactions for Protein: Q8K072

Reep4, Receptor expression-enhancing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep4Q8K072 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep4Q8K072 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms