Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rasgef1bQ8JZL7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rasgef1bQ8JZL7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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