Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trip10Q8CJ53 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip10Q8CJ53 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms