Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms