Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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