Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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