Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdc34Q8CFI2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms