Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx8Q8CFD4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms