Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms