Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam228aQ8CDW1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam228aQ8CDW1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms