Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc9Q8CDN9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc9Q8CDN9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms