Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc87Q8CDL9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms