Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms