Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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