Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacnb2Q8CC27 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms