Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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