Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phtf2Q8CB19 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phtf2Q8CB19 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms