Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C5C9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms