Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfrp1Q8C4U3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms