Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ttc21aQ8C0S4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc21aQ8C0S4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms