Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx16Q8C080 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Snx16Q8C080 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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