Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rsph4aQ8BYM7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rsph4aQ8BYM7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms