Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ube3dQ8BX13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube3dQ8BX13 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ube3dQ8BX13 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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