Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp38Q8BW70 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp38Q8BW70 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms