Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Catsper4Q8BVN3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms