Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Als2cr12Q8BVM7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Als2cr12Q8BVM7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms