Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Cxcl16Q8BSU2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl16Q8BSU2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cxcl16Q8BSU2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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