Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LsampQ8BLK3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms