Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms