Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms