Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms