Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cpped1Q8BFS6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpped1Q8BFS6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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