Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms