Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnupnQ80W37 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms