Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2q1Q7TSS2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2q1Q7TSS2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2q1Q7TSS2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2q1Q7TSS2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms