Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Dsg1bQ7TSF1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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