Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms