Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scn4bQ7M729 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scn4bQ7M729 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms